Nuo 1991-2002 m mokyklai vadovauja Valentinas Eismantas, istorikas, istorijos vyr. mokytojas, turintis vadybinės kvalifikacijos II - ą kategoriją, baigęs Vilniaus Universitetą, Demokratijos mokykloje įgyvendinimo pradininkas, tarptautinių projektų „Atviras pasaulis“, „Mikroklimato gerinimas“ iniciatorius. Gimnazijinių klasių eksperimento koordinatorius ir kūrėjas. Mokyklos meno saviveiklos rėmėjas. Mėgsta vadovautis Markaus Aurelijaus principais: „Žmonės yra gimę vienas kitam. Todėl arba mylėk juos arba pakęsk“.

1992 - 1993 mokslo metai:
Mokykloje veikia 41 mokomasis kabinetas. Mokykloje mokėsi 594 mokiniai. 326 mergaitės ir 268 berniukai. Mokyklą baigė 40 abiturientų.

1994 - 1995 mokslo metai:
Mokykla humanitarinio profilio. Vizija - kelias į gimnaziją. Su Danijos mokyklomis įsijungiama į tarptautinį eksperimentą „Psichologinio mikroklimato gerinimas mokykloje“. Šeši mokyklos mokytojai dalyvavo Danijos švietimo ministerijos organizuotuose seminaruose, o grupė gimnazistų – Lietuvos žmogaus teisių centro organizuotame seminare „Žmogaus teisių mokymas“. Dvi gimnazistų klasės dalyvavo tarptautiniame projekte. suformuota mokyklos tarybos mokinių frakcija, kurios vaidmuo priimant svarbius mokymo ir popamokinės veiklos sprendimus kokybiškai išaugo. Išrenkamas moksleivių prezidentas.

1996 - 1998 metais mokyklos gimnazistai ir mokytojai dalyvavo tarptautiniame projekte „Atviras pasaulis“. Palaikomi ryšiai su Danijos Vyborgo ir Ornus miesto gimnazijomis. Įkurta skautų draugovė.

1997 metais sprendžiamas klausimas dėl gimnazijos įkūrimo. Brendo dilema sujungti I – ąją ir katalikiškos dvasios „Saulės“ vidurines mokyklas ir iš abiejų įkurti „Saulės“ gimnaziją. 1999-06-11 Švietimo ir mokslo ministro įsakymu Nr. 760 Utenos 1 – ajai vidurinei mokyklai suteiktas gimnazijos (humanitarinio profilio) statusas, susijungiant su katalikiškos dvasios „Saulės“ vidurine mokykla. „Saulės“ gimnazijos direktoriumi paskirtas Valentinas Eismantas. Direktoriaus pavaduotojai: Vilius Nenėnas, Birutė Juodvalkienė, Nijolė Zabukienė, kun. Algirdas Butė. Pavaduotojas ūkio reikalams - Vytautas Lapašinskas. Gimnazijoje sukomplektuotos 44 klasės. Iš jų 8 – gimnazijos. Atvyko mokytis 1305 moksleiviai.

2001 metais gautas gimnazijos realinio profilio statusas.